Климат Филиппин тропический, муссонный. В разных местах погода несколько различается в зависимости от рельефа и степени удаленности местности от океана. Разница между самым жарким и самым прохладным месяцами на севере составляет 4°С, а на юге еще меньше.
Средняя годовая температура на равнинах 27°С. Годовая норма осадков на Филиппинах обычно превышает 2000 мм. В летние и осенние месяцы с востока и северо-востока на Лусон и Висайские о-ва периодически обрушиваются тайфуны. С продолжительными ливневыми дождями связаны катастрофические паводки. Летом на острове Лусон заметен резкий контраст между жарким влажным климатом Центральной низменности и прохладным умеренным климатом Центральной Кордильеры, где расположен город Багио, прежняя "летняя столица" страны.
Лучшее время для посещения Филиппинских островов - ноябрь – май.